Mérida es un lugar privilegiado ya que se encuentra al paso de la  A-5  que enlaza Madrid- Lisboa, y también en la vía  A-66 ,  Ruta de la Plata que también tiene en Mérida su punto de enlace en su tramo de Gijón con Sevilla.

Por carretera:
A-5  Madrid - Lisboa. Comunica la ciudad con las dos capitales peninsulares. Esta Autovía circunvala la ciudad por el norte, compartiendo parte de su trazado con la A-66. Entre Madrid y Mérida hay una distancia de 343 km.
A-66  Gijón - Sevilla. Autovía nacional que une la ciudad con el norte y el sur por el oeste peninsular.
N-430  Badajoz - Valencia, que entre Badajoz y Torrefresneda comparte trazado con la Autovía  A-5 . Está carretera ya está convertida en la Autovía  A-43  en su gran parte, faltando concretar su trazado entre Puertollano y Torrefresneda.
EX-209  Badajoz a Mérida por Montijo. Carretera regional intercomarcal que une la capital extremeña con los pueblos occidentales de su comarca y con la Tierra de Badajoz, incluida su capital.
BA-058  Don Álvaro - Mérida.

La ciudad cuenta con una Estación de Autobuses Interurbanos gestionada por la Junta de Extremadura con trayectos regionales, nacionales e internacionales.

Por Ferrocarril:
La Estación de Mérida está situada en el límite del centro histórico de la ciudad. Es gestionada por ADIF. Enlaces directos con las siguientes localidades:
Línea Badajoz-Ciudad Real: Badajoz, Don Benito, Villanueva de la Serena, Puertollano, Ciudad Real y otras poblaciones menores.
Línea Mérida-Sevilla: Almendralejo, Zafra, Sevilla y otras poblaciones menores.
Línea Mérida-Madrid: Cáceres, Plasencia, Talavera de la Reina, Madrid y otras poblaciones menores.